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Retina-Organoide für die Einzelzell-RNA-Sequenzierung

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Gruppe Opthalmologische Onkologie & Genetik; Institut für Humangenetik

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Auf dieser Grundlage wurde die klinische Forschungsgruppe "Ophthalmische Onkologie und Genetik" eingerichtet. Die Spezialambulanzen in der Augen- und Kinderklinik sowie in der Humangenetik bilden die Basis der Forschungsgruppe. Auf dieser Basis wurde ein Netzwerk wissenschaftlicher Projekte in drei Projektbereichen aufgebaut, die sich mit Fragestellungen aus der Schnittmenge von klinischer und Grundlagenforschung beschäftigen.

"Die Handhabung des Cellbox-Fluges war einfach

und bequem.

Es gab keinen Unterschied im

aussehen der Netzhautorganoide

vor und nach dem Transport."

DAS PROJEKT

Ein Organoid ist ein aus Primärgewebe, embryonalen Stammzellen oder induzierten pluripotenten Stammzellen abgeleiteter in vitro-3D-Zellverband, der zur Selbsterneuerung und Selbstorganisation fähig ist und eine ähnliche Organfunktionalität wie das Ursprungsgewebe aufweist. Die aus hPSC gewonnenen 3D-Organoide der Netzhaut sind eine Anwendung dieses neuen Modells. Dieses Projekt fasst den Transport dieser komplexen Strukturen und die anschließende Auswertung für die Einzelzell-RNA-Sequenzierung zusammen. Die Einzelzellsequenzierung bezieht sich auf die Sequenzierung eines Einzelzellgenoms oder -transkriptoms, um Genom-, Transkriptom- oder andere Multi-omics-Informationen zu erhalten und so Unterschiede zwischen Zellpopulationen und zelluläre evolutionäre Beziehungen aufzudecken. Sie erfordert die Isolierung und Lyse einzelner Zellen, die Umwandlung ihrer RNA in cDNA und die Amplifikation der cDNA zur Erzeugung.

- Gruppe Ophtalmische Onkologie & Genetik; Institut für Humangenetik

November, 2020

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