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#Neues aus der Industrie
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Neue Weise, Zellen ohne Beschränkungen der traditionellen Methoden zu sortieren
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Die Methode ist dem Analysieren eines Smoothie, um zu finden, welche Früchte in die Herstellung sie einstiegen, die Forscher sagen analog
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Eine Mannschaft der Universität von Stanfords-Fakultätforscher hat mit einer neuen Weise des Analysierens der einzelnen Zellenarten aufgekommen, indem sie vorgerückte mathematische Analyse an den Zellen anwendete? Inhalt.
Die Methode ist dem Analysieren eines Smoothie, um zu finden, welche Früchte in die Herstellung sie einstiegen, die Forscher sagen analog. Ein Papier, welches die Methode, genannt Cibersort beschreibt, wurde on-line-30. März in den Natur-Methoden veröffentlicht.
Einzelne Zellen entsprechend den Proteinen zu analysieren und das Sortieren, die sie auf ihren Oberflächen anzeigen, ist ein wesentlicher Bestandteil Stammzellewissenschaft und Krebsforschung. Indem sie diese Proteine analysieren, bekannt als Zellenoberflächenmarkierungen, können Wissenschaftler herausfinden, mit was ein bisschen Zellen sie wirst und sehen beschäftigen, wie die Zelle probiert, über einen Zeitraum genommen von einem Tier, Änderung.
Mit Krebs können das Vorhandensein oder das Fehlen bestimmten Zellenmarkierungen sehr großes bei einem Patienten unterscheiden? s-Prognose und welche Behandlungen am wirkungsvollsten sind.
Aber viele Arten Gewebedose? t wird leicht oder genau unter Verwendung der gegenwärtigen Methoden der Zelle sortierend analysiert und hemmt Wissenschaftler? Fähigkeit, Forschung und Kliniker zu tun? Fähigkeit, die wirkungsvollsten Therapien für Krebs und andere Krankheiten zu finden.
? Das grundlegende Problem ist, dass wir häufig Zellenbevölkerungen in den Geweben zählen möchten, aber wir bauen auf Methoden, die Gewebe erfordern, in einzelne Zellen gesammelt zu werden und gespeichert zu werden, dann getrennt zu werden oder in Abschnitte geschnitten zu werden, und dann beschriftet worden mit Antikörpern zu den spezifischen Markierungen? besagte Asche Alizadeh, MD, PhD, Assistenzprofessor von Medizin und der ältere Autor vom Papier. ? Jeder dieser Schritte hat Beschränkungen.?
Wie Zellen sortiert werden
Vor Dekaden, gehörten Stanford-Forscher zu der Welt? s-Führer, wenn sie eine Methode für das Analysieren der Zellen entwickelten, nannten Fluss cytometry. Mit dieser Methode werden Gewebe zuerst in einzelne Zellen getrennt und ausgesetzt Leuchtstoff beschrifteten Antikörpern, die zu den bestimmten Zellenoberflächenmarkierungen anbringen. Dann werden einige Zellen auf einmal, in den kleinen Tropfen des Wassers, vor einem Laser geführt, der die Leuchtstoffantikörper und einen Optik-Sensor aufregt, der jede Art Zelle im Tropfen zählt. In einigen Maschinen können die verschiedenen Arten der Zellen in verschiedene Behälter sortiert werden.
Von können Sie ein Gewebe nehmen, es oben mischen, den Inhalt betrachten und erklären, welchen Arten der Zellen sie kamen?
Die Standardmethode des Zellensortierens erfordert Gewebe oben brechen, oder, sie, in einzelne Zellen zerlegend, sagte Alizadeh. Dieses ist ein rauer Prozess, der bestimmte Zellenarten zerstört und einige Gewebe unbrauchbar für Studie macht. Zusätzlich bildet die traditionelle Methode des Erhalts der medizinischen Proben es unmöglich, sie auf diese Art zu verarbeiten, er merkte. Auch Leuchtstoff beschriftet Antikörper muss für jedes spezifische Zellenprotein produziert werden, an dem die Wissenschaftler interessiert sind. Antikörper können möglicherweise nicht für etwas Proteine vorhanden sein, sagte er.
Die Lösung, welche die Forscher mit aufkamen, ist, nicht die Zellen, aber ihren Inhalt zu sortieren. ? Wir baten? Von können Sie ein Gewebe nehmen, es oben mischen, den Inhalt betrachten und erklären, welchen Arten der Zellen sie?? kamen? Alizadeh sagte.
Wiederaufbau das zellulare? Smoothie?
Wenn sie die neue Methode entwickelten, konzentrierten sich Alizadeh und seine Kollegen nicht auf den Proteinzellen-Oberflächenmarkierungen, aber auf die RNS, auf der jene Proteine gekopiert wurden. Habilitationsgelehrter Aaron Newman, PhD, plante einen Computeralgorithmus, um die Art und die Zahl den ursprünglichen Zellen wieder aufzubauen, die auf den RNS-Gehalt der Mischung aller Zellen basierten.
? Es? s mögen einen Smoothie wieder aufbauen? besagter Newman, ein führender Autor des Papiers. ? Sie wissen, dass es viele verschiedenen Arten Frucht in ihm hat, aber Sie anziehen? t wissen sofort, wieviele jeder Art. Jedoch konnten Sie wissen, dass Erdbeeren einen bestimmten Betrag Zucker und roten Farbton hatten, während Orangen eine andere Menge Zucker, orange Farbton und mehr Tartness haben. Wenn Sie jede dieser Qualitäten analysieren, können Sie wieder aufbauen, wieviele jeder Art Frucht in die Herstellung des Smoothie. einstiegen?
Zusätzlich zur Vermeidung der Probleme zugehörig, wenn oben Gewebe in Einzelzellen, die Forscher gebrochen sind, die diese gewonnene Methode anwenden? beschriftete Antikörper der t-Notwendigkeit Leuchtstoff für nach die Zellenoberflächenmarkierungen, die sie suchen, sagte er.
Wenn wir Cibersort an den Krebsgeweben anwenden, denken wir, dass wir in der Lage sind, erstaunliche Sachen zu sehen.
Einige der aufregendsten neuen Fortschritte in der Behandlung von Krebs beziehen den Gebrauch der neuen Drogen mit ein, die immune Antworten bei Patienten sich engagieren, die Krankheit zu kämpfen. Diese Drogen zielen häufig auf die seltenen und schlafenden Bevölkerungen der immunen Zellen ab, die innerhalb der Tumoren liegen. Während einige dieser Drogen für Patienten mit sehr verschiedenen Tumorarten wirkungsvoll drastisch sein können, scheinen Nutzen nicht jedes Patienten gleichmäßig und eine Tumorarten, nicht auf diese neuen immunen Therapien zu reagieren.
? Eine bedeutende, laufende Bemühung ist, zu finden, welche immunen Zellen Antwort und Widerstand zu diesen Drogen vermitteln, um ihr verwiesen zu erlauben und Gebrauch auf eine personifizierte Art und Weise zu präzisieren? besagtes Alizadeh, das auch ein Mitglied des Stanford-Instituts für Stammzelle-Biologie und verbessernde Medizin und des Stanford-Krebs-Instituts ist. ? Wenn wir Cibersort an den Krebsgeweben anwenden, denken wir, dass wir in der Lage sind, erstaunliche Sachen zu sehen.?
Zielen von Krebsbehandlungen
Wenn die Forscher Cibersort an den alten Tumorproben von den Patienten anwenden, deren klinische Geschichte bekannt, können sie sein, zu erlernen, welche Arten der Zellen mehr oder weniger tödlichen Krebsen signalisieren. Sie können auch erlernen, welche Arten von Behandlungen besseres oder schlechteres in den verschiedenen Formationsgliedern von Krebs bearbeiten. Diese Art der Informationen konnte für die Antikörperkrebstherapien am wichtigsten sein.
? Dort sind frühe Tips, dass auszukennen sehr ist wichtig, in dem Vorhandensein der spezifischen Arten der immunen Zellen im Tumor, bevor und nachdem bestimmte Therapien gegeben werden, und wie ändern jene Zellen im Laufe der Zeit? Alizadeh sagte.
Der andere führende Autor des Papiers ist Chih langer Liu, PhD, ein Forschungsteilnehmer in Alizadeh? s-Labor. Andere Stanford-Mitverfasser sind Maximilian Diehn, MD, PhD, Assistenzprofessor von Strahlungsonkologie; Chuong Hoang, MD, ehemaliger Assistenzprofessor der Brust- Chirurgie; ehemaliges Habilitationsgelehrter Michael-Grün, PhD; älterer Forschungsingenieur Andrew mildert, PhD; ehemaliger Forschungsteilnehmer Weiguo Feng, PhD; und älterer Forschungswissenschaftler Yue Xu, MD, PhD.
Diese Arbeit wurde durch Bewilligungen vom Doris Herzog barmherzige Grundlage, die Damon Runyon Krebsforschung-Grundlage, die B&J Kardangelenk-Onkologie-Forschungs-Kapital, das Ludwig-Institut für Krebsforschung, die nationalen Institute der Gesundheit (Bewilligungen U01CA154969, U19AI090019 und CA09302-35), das US-Verteidigungsministerium und eine Bewilligung vom Siebel Stammzelle-Institut und von der Thomas und Stacey Siebel Grundlage gestützt.
Stanford? s-Abteilung von Medizin stützte auch die Arbeit.