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#Neues aus der Industrie
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Microsatellite-Instabilitäts-Probe validiert für Krebs-Studien
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Microsatellite-Instabilität (MSI) tritt auf, wenn Fehlanpassungsreparaturproteine (MMR) einen DNA-Reproduktionsfehler regeln nicht können und führt zu Rahmenschiebeveränderungen im genetischen Code und in den nicht-arbeitenden Proteinen einer Person. MSI ist als eine starke Markierung für genetische Bedingungen wie Lynch-Syndrom aufgetreten, das zu eine Vielzahl von Krebsen führen kann.
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Mehrfache Firmen haben MSI-Proben entwickelt, um eine Vielzahl von Anfangsstadiumkrebsen zu ermitteln. Die US Food and Drug Administration (FDA Silver Springs, MD, USA) haben Durchbruch-Gerätebezeichnung zwei Firmen für ihre vorhandene zukünftige der Reihe nach ordnende flüssige Biopsie RUO prüfen, um MSI-Entdeckung einzuschließen bewilligt. Im Rahmen des Programms arbeitet FDA mit einem Testentwickler, um die Zeit und die Kosten von Entwicklung zu Zustimmung zu verringern.
Ein wissenschaftliches Team von Erinnerungs-Sloan Kettering Cancer Center (MSKCC, New York, NY, USA) stellte vor kurzem unveröffentlichte Bestätigungsuntersuchungen über die Idylla-microsatellite Instabilitätsprobe dar, die seine Fähigkeit zeigt, Spuren von Tumorveränderungen in einer Vielzahl von Krebsen wie endometrial und colorectal Krebsgeschwür zu ermitteln.
Das MSKCC-Team validierte den Gebrauch von der Probe Idylla MSI für Zeitlupeneinschätzung von MSI-Status auf Formalin-örtlich festgelegten, Paraffin-eingebetteten (FFPE-) Gewebeschnitten ohne den Bedarf an früherer DNA-Extraktion oder gleichzeitiger Prüfung mit einer normalen Steuerung. Das Team überprüfte 52 Tumorproben: 38 FFPE und 14 extrahierten DNA, mit bekanntem MSI-Status und ließen sie auf der Probe Idylla MSI laufen. Das Team beschriftete die Proben basiert auf dem Vorhandensein der Instabilität in den sieben Markierungen: wenn die Proben zwei hatten oder instabilere Biomarkers, galten sie als MSI-H; wenn die Proben weniger als zwei instabile Biomarkers hatten, galten sie als MSI-Stall (MSS).
Das Team verglich dann die Ergebnisse mit vorher entschlossenem MSI-Status, der auf NGS-Daten basierte, die durch MSK-IMPACT, ein MSI-PCR Werkzeug und eine MMR-Immunohistochemistryprobe erzeugt wurden. Das Team fand übereinstimmende Ergebnisse für 24 von 25 MSI-H und 26 von 27 der MSS-Fälle zwischen Proben Biocartis und Promegas, für eine Gesamtübereinstimmung von 96%. Die Wissenschaftler forderten vier Minuten praktische Zeit, die Probe, mit ungefähr 150 Minuten von Einrichtung zu Berichtsgeneration laufen zu lassen. Die Forscher stellten fest, dass der Test Idylla MSI eine einfache und völlig automatisierte Lösung für MSI-Statusbestimmung ist und schnelle Ergebnisse bereitstellt, die mit anderen MSI-Prüfungsansätze übereinstimmend sind. Die Studie wurde an der Vereinigung für molekulare Pathologiejahresversammlung hielt 1. bis 3. November 2018, in San Antonio, TX, USA dargestellt.